从字面意义讲，一般指一事物内部各组成部分或某些相关事物在某种特定条件下从无序的、分散的状态进入新的有序的或整体的状态。具体讲，在智能气功科学理论中，整合有以下几个含义：
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①意元体中众多杂乱无章的分散的信息通过有机的、符合客观的自我组合，形成一个整体信息结构序或整体信息。前者标志着一个常态意念指令的形成；后者属超常智能意识(整体性思维)的呈现，这个超常意识产生的同时往往直接化作意识行动而呈现某种结果。
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②意元体由被各种常态信息干扰的“四分五裂”的功能状态转入超常的整体功能状态。
③构成某一事物整体的内在联系的各个组成部分按照一定的秩序协同运动，从而使该事物整体功能有序化。如：生命活动得到重新整合。
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④指时空结构混化。两个或两个以上的事物各自打破自己原有的整体特性，重新组合成一个新的整体时空结构；或复杂事物原整体时空结构破坏，内部各组元有了相对独立性，互相混化形成新的时空结构的过程。
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也指一个事物失去自己原有特性，被另一事物同化而成为其整体的一个组成部分。如：信息整合；把基砖整合到特定的时空结构中。
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